До середины 50-х годов прошлого века защита населения и территории Алтайского края осуществлялась в общей системе местной противовоздушной обороны страны. В этот период отдельных органов управления МПВО на территории края не было. Мероприятия по местной ПВО в масштабе края планировались и проводились разными ведомствами. Так в этот период обязательное обучение населения МПВО возлагалось на ДОСААФ. В целом управление всеми мероприятиями осуществлялось МВД СССР

В соответствии с Постановлением Совета Министров РСФСР от 05.08.1955 года № 986–118 с.с. решением «СЗ» Алтайского крайисполкома от 26.09.1955 года создан штаб МПВО Алтайского края. Общее руководство за созданием системы гражданской обороны крупнейших промышленных городов края Барнаула, Бийска, Новоалтайска, Рубцовска осуществлял один из отделов штаба МПВО Алтайского края.

В соответствии с Постановлением ЦК КПСС и Совета Министров СССР от 13.07.1961 года № 639–275 Постановлением бюро Алтайского крайкома КПСС и Алтайского крайисполкома № 612 - и от 11.09.1961 года Штаб МПВО Алтайского края преобразован в Штаб ГО Алтайского края. Общее руководство за созданием системы гражданской обороны крупнейших промышленных городов края Барнаула, Бийска, Новоалтайска, Рубцовска осуществлял один из отделов штаба Гражданской обороны края. В начале 60-х годов XXвека были заложены правовые и материальные основы самостоятельной системы гражданской обороны городов края.

Из состава ДОСААФ были выведены существовавшие ранее школы ГО и переданы в подчинение органов ГО на местах.

Принято постановление "О пропаганде знаний гражданской обороны“, в соответствии с которым создавались учебные пункты, кабинеты, классы и уголки ГО.

В России был создан Российский корпус спасателей — именно эту дату сегодня считают днём рождения МЧС России. Уже через год структура получила статус Государственного комитета по чрезвычайным ситуациям, а затем была преобразована в Министерство Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий.

В Алтайском крае эти изменения стали началом большой и важной работы по созданию собственной системы безопасности населения. В 1990 году Штаб гражданской обороны Алтайского края возглавил полковник Владимир Семёнович Ковалёв. Постепенно региональная структура вошла в состав формирующейся общероссийской системы реагирования на чрезвычайные ситуации

В начале 1990-х годов в стране была создана Российская система предупреждения и действий в чрезвычайных ситуациях — РСЧС. На Алтае начали формироваться поисково-спасательные подразделения, развивалась система оперативного реагирования, создавались первые специализированные службы. Уже тогда спасатели региона принимали участие в ликвидации последствий паводков, ураганов, крупных аварий и пожаров как в крае, так и далеко за его пределами — например, после землетрясения в Нефтегорске и авиакатастрофы под Междуреченском.

Во исполнение Указа Президента Российской Федерации от 27.05.1996 года № 784, Постановления Правительства Российской Федерации от 23.11.1996 года № 1396 и в соответствии с директивным указанием Министра Российской Федерации по делам ГОЧС и ликвидации последствий стихийных бедствий от 27.02.1997 года № 42–14–31 Штаб ГО Алтайского края постановлением администрации Алтайского края от 02.06.1997 года № 331 реорганизован в Главное управление по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям Алтайского края

Постановлением Законодательного Собрания Алтайского края от 16.03.1998 года № 89 принят закон Алтайского края “О защите населения и территории Алтайского края от чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера». В составе Главного управления ГОЧС Алтайского края создан поисково-спасательный отряд. ГУ ГОЧС края подчинены Центральная спасательная станция на воде, группа разведывательных и специальных подводных работ

В соответствии с Указом Президента РФ от 9 ноября 2001 г. №1309 в целях совершенствования государственного управления в области пожарной безопасности, повышения готовности единой государственной системы предупреждения и ликвидации ЧС, объединения сил и средств при организации и проведении первоочередных работ, связанных с тушением пожаров, руководствуясь ст. 80 Конституции РФ, государственная противопожарная служба Министерства внутренних дел РФ преобразована в государственную противопожарную службу Министерства Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайных ситуаций и ликвидации последствий стихийных бедствий.

28 августа 2003 года вышел указ Президента РФ № 991 "О совершенствовании единой государственной системы предупреждения и ликвидации чрезвычайных ситуаций”. Находящаяся в ведении Министерства природных ресурсов, Государственная инспекция по маломерным судам РФ передана в ведение МЧС России

19 ноября 2004 года. Правительства Российской Федерации приняло постановление №657 “Об утверждении Соглашения между Министерством Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий и администрацией Алтайского края о передаче друг другу осуществления части своих полномочий в решении вопросов организации тушения пожаров и предупреждения чрезвычайных ситуаций межмуниципального и регионального характера, стихийных бедствий и ликвидации их последствий»

Во исполнение приказа МЧС России №37–2 от 6 августа 2004 года Главное управление по делам ГО и ЧС Алтайского края преобразовано в Главное управление Министерства Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий по Алтайскому краю. 
На основании Постановления администрации Алтайского края №166 от 3 марта 2005 года создано КГУ "Управление по обеспечению мероприятий в области гражданской обороны, чрезвычайных ситуаций и пожарной безопасности в Алтайском крае" - сегодня известное как Управление Алтайского края по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и пожарной безопасности. Новая структура объединила усилия по защите населения, предупреждению чрезвычайных ситуаций, развитию пожарной безопасности и организации спасательных работ.
Принят Закон Алтайского края от 10 февраля 2005 г. № 4-ЗС "О пожарной безопасности в Алтайском крае“.

Принят Закон Алтайского края от 14 сентября 2006 г. № 93-ЗС "О наделении органов местного самоуправления государственными полномочиями по организации тушения пожаров".

Губернатор Алтайского края А. Б. Карлин подписал Постановление Администрации Алтайского края от 1 декабря 2008 г. N 500 "О государственной противопожарной службе Алтайского края"

В соответствии с Постановлением Администрации Алтайского края от 1 декабря 2008 г. N 500 «О государственной противопожарной службе Алтайского края». Для обеспечения высокой эффективности пожарной безопасности в УГОЧС и ПБ в Алтайском крае создана группировка краевой ГПС в составе 77 пожарных частей

Приняты законы Алтайского края :
от 5 июля 2010 года № 49-ЗС «О внесении изменений в закон Алтайского края «О защите населения и территории Алтайского края от чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера»;
от 14 сентября 2010 года № 73-ЗС «О единовременной материальной помощи и компенсации за утраченное жилье гражданам, пострадавшим вследствие чрезвычайной ситуации, сложившейся в результате природных пожаров на территории Михайловского района Алтайского края в сентябре 2010 года»;
Разработана краевая целевая программа «Снижение рисков и смягчение последствий чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера в Алтайском крае» на 2011-2013 годы, закрепляющая основные направления работы по снижению рисков и смягчению последствий аварий, катастроф и стихийных бедствий в Алтайском крае для повышения уровня защиты населения и территорий от ЧС природного и техногенного характера.

Правительство Российской Федерации приняло распоряжение от 11 апреля 2011 года № 609-р «Об утверждения Соглашения между МЧС России и Администрацией Алтайского края о передаче друг другу осуществления части своих полномочий в решении вопросов организации тушения пожаров и предупреждения чрезвычайных ситуаций межмуниципального и межрегионального характера, стихийных бедствий и ликвидации их последствий».
Принят Закон Алтайского края от 10.10.2011 № 126-ЗС «О добровольной пожарной охране», Постановление Алтайского краевого Законодательного Собрания от 04.07.2011 № 358 «О ходе выполнения законов Алтайского края «О пожарной безопасности в Алтайском крае» и «О защите населения и территории Алтайского края от чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера».
Создано 77 пожарных частей противопожарной службы Алтайского края (всего 154), а также 40 подразделений добровольной пожарной охраны, из них 30 подразделений с выездной пожарной техникой (команд) и 10 добровольных пожарных дружин. Прикрытие населенных пунктов выросло с 86,11% до 89,88 % (рост составил 3,77 %)

Основу группировки сил на территории края составляют специально подготовленные поисково-спасательные формирования, пожарно-спасательные части и формирования ведомств и предприятий, в том числе:
одно федеральное – ЗСПСО им. В.В. Зюкова, филиал СРПСО МЧС РФ;
два субъектовых – ПСО и ПСО на акваториях ККУ «Управление по обеспечению по обеспечению мероприятий в области ГО, ЧС и ПБ в Алтайском крае»;
три муниципальных – ПСО Управления по делам ГОЧС г. Рубцовска, Бийский ПСО муниципального учреждения «Бийская служба спасения» и аварийно-спасательная пожарная служба г. Новоалтайска,
пожарные и восстановительные поезда Алтайского отделения Западно-Сибирской железной дороги – филиала ОАО «РЖД».бригады экстренной медицинской помощи КГУ здравоохранения «Краевой центр медицины катастроф»;аварийно-восстановительная группа Алтайского линейного управления магистральным газопроводом и др.
Для обеспечения противопожарной защиты населения в Алтайском крае действует группировка ГПС, в состав которой входят: органы управления и подразделения ФПС и ГПС Алтайского края, а также другие виды пожарной охраны, деятельность которых координирует ГПС.В состав ГПС входят 225 подразделений (из них: 4 отдела по координации деятельности, 48 отрядов, 15 самостоятельных пожарных частей по охране муниципальных образований). Общая штатная численность личного состава ГПС – 3940 человек Силами и средствами других видов пожарной охраны являются 787 пожарных формирований, в том числе 607 команд с выездной техникой. Общая численность личного состава этих формирований – 2401 человек, на вооружении которых находится 359 единиц пожарной и 330 единиц прис-пособленной техники. Взаимодействие всех сил и средств пожарной охраны организовано в соответствии с Планом привлечения сил и средств подразделений пожарной охраны на территории Алтайского края, утвержденным распоряжением администрации края от 27.04.2005 года №257.
Всего ежесуточно на боевом дежурстве в крае находится свыше 1450 человек, более 630 единиц техники.

В соответствии с законом Алтайского края от 14.09.2006 № 98-ЗС «О порядке управления и распоряжения государственной собственностью Алтайского края» Правительство Алтайского края постановило о переименовании краевого казенного учреждения «Управление по обеспечению мероприятий в области гражданской обороны, чрезвычайных ситуаций и пожарной безопасности в Алтайском крае» в краевое казенное учреждение «Управление Алтайского края по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и пожарной безопасности»

На основании указа Губернатора Алтайского края №203 было официально создано 25 декабря 2024 года Управление гражданской обороны и защиты населения Алтайского края (УГОЗН Алтайского края). С 1 января 2025 года УГОЗН Алтайского края начало полноценную работу как самостоятельный исполнительный орган, подчинённый непосредственно Правительству Алтайского края

Правительством Алтайского края было принято постановление № 11, которым внесены изменения в ранее действующее постановление от 3 марта 2005 года № 116 о создании краевого учреждения в сфере гражданской обороны, чрезвычайных ситуаций и пожарной безопасности.
Документ закрепил важные организационные изменения: учредителем краевого казённого учреждения стало Управление гражданской обороны и защиты населения Алтайского края